Proteómica

La proteómica de escopeta es una técnica proteómica ascendente para identificar proteínas en mezclas complejas mediante espectrometría de masas.

A menudo se combinan múltiples métodos de fraccionamiento o separación para mejorar la relación señal-ruido y la cobertura del proteoma y para reducir las interferencias entre péptidos en la proteómica cuantitativa. Además, un determinado método de fraccionamiento proporciona información adicional sobre los analitos, como el peso molecular, la hidrofobicidad o el punto isoeléctrico, que puede utilizarse para mejorar la identificación y para descubrir variantes de empalme de proteínas o grandes modificaciones postraduccionales.

Tras la lisis o el aislamiento celular, los lisados suelen contener contaminantes que no son compatibles con los pasos posteriores.

 

AFFINISEP ha desarrollado herramientas especiales basadas en los discos AttractSPE que pueden de las muestras de forma sencilla y eficaz:

  • Desalar :
    Antes del análisis por EM de péptidos o proteínas, la etapa de desalación es un paso crucial para eliminar las sales y purificar los péptidos/proteínas de los digeridos en gel y en solución.
    La elección del sorbente es importante, ya que el sorbente se unirá a los péptidos y permitirá que la sal y otros contaminantes sean lavados de la muestra. A continuación, los péptidos y las proteínas limpias se eluyen y se analizan.
  • Fraccionar :
    El fraccionamiento de péptidos es un paso extremadamente importante y desafiante en los enfoques proteómicos que se enfrentan a mezclas cada vez más complejas.
    El objetivo es simplificar cada fracción para un análisis simplificado que permita extraer más información.
  • Eliminar detergentes :
    Para una buena solubilización de las proteínas y sus digestiones, se requieren detergentes.
    Estos compuestos pueden afectar a la identificación de péptidos/proteínas y su eliminación es un paso importante para una mayor identificación de péptidos.
  • Intercambiar tampón.

Se pueden utilizar varios sorbentes como HLB, C18, C8, DVB (hidrofóbicos), polímeros iónicos para interacciones débiles o fuertes (RPS,SAX, WAX, SCX, WCX)… El producto existe bajo varios formatos de Stage tips (SPE tips), Spin SPE, 96 Plates SPE (1mL o para microelución) o columnas SPE basadas en discos. Si necesita ampliar su purificación, exactamente la misma resina está disponible en formato de cartucho.
Hay varios formatos disponibles según el tamaño de la muestra: puntas SPE, tubos giratorios de 2 ml/15 ml/50 ml, cartuchos con discos SPE o placas de 96 pocillos de 1 ml/microelución.

Para responder a la necesidad de un alto rendimiento y una rápida eliminación de pequeñas moléculas de las preparaciones de muestras de proteínas, hemos ampliado nuestra oferta con placas de 96 SPE.